徐州市疾控中心完成二代全基因组测序平台搭建-0008全讯注册
为有效应对新型冠状病毒肺炎疫情,给徐州市的传染病病原快速鉴定和新冠疫情流调溯源提供高端800cc全讯白菜的技术支持,徐州市疾控中心在7月末购入高通量二代测序仪后,立即集中骨干力量,迅速启动攻坚任务,努力探索,先后攻克rna定量,文库构建、模板制备,测序,数据分析等各项任务,首次独立完成了新冠病毒基因组测序实验,成功建立了高通量测序(ngs)技术平台。
7月28—31日,疾控中心第一时间邀请工程师进行仪器的安装与调试,组装调试完成后,工程师从测序原理、日常维护及使用、文库制备、上机操作、数据比对分析等方面做了详细的培训。在工程师指导下,市疾控微生物检验科工作人员顺利完成了4份标本的测序工作。经过两天严谨的实验操作,完成了核酸提取、全基因组扩增、纯化、rna定量、文库构建等操作步骤,再经过基因测序仪数据的运算分析和序列分析比对,得出的结果符合要求。
这表明徐州市疾控中心实验室已经基本具备独立完成新冠病毒基因组测序、分析的能力,成为省内具备开展传染病病原基因测序能力的市级实验室。下一步,徐州市疾控中心将继续开展人员培训,储备技术力量,夯实高通量测序技术平台,以便迅速开展新冠病毒测序分析,为我市新冠疫情防控做出更精准的800cc全讯白菜的技术支持。
拟稿:高雪
核稿:童晶